Основными задачами Агентства являются:
формирование и обеспечение реализации совместно с Министерством экономики и другими заинтересованными федеральными органами исполнительной власти государственной научно-технической и промышленной политики в сфере радиоэлектроники и систем управления, направленной на обеспечение конкурентоспособности производимой продукции, развитие и эффективное использование научно-технического и производственного потенциала, внедрение прогрессивных технологий;
участие совместно с Министерством обороны и другими государственными заказчиками в формировании государственной программы вооружения, государственного оборонного заказа;
разработка совместно с заинтересованными федеральными органами исполнительной власти и организациями и представление проектов федеральных целевых и межгосударственных программ в области радиоэлектроники и систем управления, доведение их до соответствующих предприятий и организаций;
организация внешнеэкономической деятельности находящихся в ведении Агентства предприятий и организаций по разработке и производству вооружения и военной техники в сфере радиоэлектроники и систем управления, продукции гражданского и двойного назначения;
реализация государственной политики в области стандартизации, метрологии и управления качеством радиоэлектронной техники;
выполнение других задач и функций, подробно изложенных в Положении.
Вновь созданным агентствам передано также право, которое было предоставлено Минэкономики России постановлением Правительства от 11 февраля 1999 г.*, осуществлять функции нормативно-правового регулирования, специальные разрешительные, контрольные или надзорные функции в области промышленной безопасности при производстве соответствующих работ на опасных производственных объектах.