Согласно постановлению Правительства от 24 ноября 1999г*. Госкомэкология России является также специально уполномоченным федеральным органом исполнительной власти в области охраны атмосферного воздуха. Свою деятельность в этой области Комитет осуществляет совместно с Министерством здравоохранения РФ, Федеральной службой России по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды, другими федеральными органами исполнительной власти в пределах их компетенции и взаимодействует с органами исполнительной власти субъектов Федерации.
* СЗ РФ. 1999. № 48. Ст. 5866
Основными задачами Госкомэкологии России в области охраны окружающей среды, обеспечения экологической безопасности, сохранения биологического разнообразия и обращения с отходами являются:
осуществление государственной политики, государственного управления и контроля;
межотраслевая координация деятельности органов исполнительной власти и организаций;
организация и осуществление государственного экологического контроля, государственного контроля за охраной атмосферного воздуха, а также в пределах своей компетенции государственного контроля за использованием, воспроизводством и охраной отдельных видов природных ресурсов и объектов;
формирование нормативно-правовой и инструктивно-методической базы и проведение единой научно-технической политики;
регулирование в пределах своей компетенции совместно с другими федеральными органами исполнительной власти природопользования в целях охраны окружающей среды, обеспечения экологической безопасности и сохранения биологического разнообразия;